2016: Les Avengers découvrent un complexe secret, et pensent y récupérer le sceptre. Depuis l'attaque de 2011, Loki a pas mal fait joujoue avec le cube, voyageant dans divers mondes et univers. Dans l'une de ses escapades, il y découvre plusieurs futurs auxquels sa mort définitive a eu lieu, et décide d'agir. Récupérant le sceptre peu avant Tony, il laisse un faux aux mains des Avengers. C'est au côté du Dr Fatalis que Loki trouve un allié dans son plan, bientôt rejoint par Wanda et Pietro, mais lorsque Fatalis commence à exposer son projet autour du sceptre, Wanda prend peur et s'enfuit avec ce dernier au côté de son frère, rapportant l'objet aux avengers. Le projet Ultron est alors reporté.

Fin 2016, le premier mutant est arrivé sur terre. Le Shield, voyant une anomalie sur leurs radars, s'occupe vite de ce dernier. Pendant ce temps, Loki suit son plan initiale, relevant à Fatalis que son projet de dominer la terre n'est plus au centre de ses préoccupations.

2017: juin, une forte population mutante apparaît dans le monde. L'un des premiers à arriver est le célèbre Charles Xavier, qui bien vite, aider du Shield installe une école ainsi qu'un lieu de recueillement pour les mutants. Avec toute cette agitation, un sommet a lieu, regroupant les représentants de chaque pays, ainsi que deux représentants des mutants. Ororo ainsi que le professeur Charles Xavier sont présents. Lors du retour, le roi du Wakanda est tué par Ulysses Klaus. Ce dernier fait accuser les mutants, une tension commence à se sentir, mais le nouveau roi du Wakanda, bien que concerné par cette histoire, soutien les mutants, et demande la création d'un traité pour aider ces derniers. Une partie du gouvernement américain, contrôler par Hydra, souhaite plutôt le contraire.

Maintenant: la fin d'année approche, bien que la population semble préoccupée par les fêtes qui approchent, un petit groupe de vilain, soutenue par le tristement célèbre, et nouveau venue, Magneto, commence à voir le jour. Des noms célèbres se joignent à lui, accompagné par des noms encore inconnus criant vengeance. Avec une telle menace, le gouvernement ressort le dossier Ultron, projet autrefois commencé par Hank Pym, puis reprit par Tony Stark et Bruce Banner.